FileZilla остаётся самым универсальным бесплатным вариантом — поддерживает FTP, FTPS и SFTP, работает на Windows, macOS и Linux одинаково.
WinSCP удобнее для тех, кто уже привык работать с SSH-подключениями — интерфейс похож на обычный файловый менеджер с двумя панелями.
Total Commander со встроенным FTP-плагином подойдёт тем, кто и так использует его как основной файловый менеджер — не нужно переключаться между программами.