Akeeba Backup остаётся стандартом резервного копирования для Joomla именно потому, что делает полный снапшот — файлы и базу данных вместе, с возможностью восстановить сайт целиком на другом хостинге.
Для регулярного бэкапа важно вынести хранение архивов за пределы того же сервера: подключить FTP, Google Drive или Яндекс.Диск через встроенные профили — если сломается хостинг, локальная копия на нём не поможет.
Отдельно стоит проверять restore хотя бы раз в несколько месяцев на тестовом окружении: бэкап, который никогда не разворачивали, нельзя считать надёжным.
# cron-задание на ежедневный бэкап в 03:00
0 3 * * * php /path/to/site/cli/akeeba-backup.php